Die Proben werden zunächst chemisch mit Aldehyden und Osmiumtetroxid fixiert und anschließend durch Überführen in steigende Konzentrationen eines organischen Lösungsmittels entwässert. Das Lösungsmittel wird dann durch flüssiges Harz ersetzt. Die Art des Harzes wird in Abhängigkeit von den Anforderungen der Probe gewählt. Nach der Polymerisierung des Harzes werden von der Probe unter Nutzung eines Diamantmessers mittels Ultramikrotom 50 – 70 nm dicke Schnitte angefertigt und auf ein Trägernetzchen überführt. Nach einer Kontrastierung der Schnitte mit Uranylacetat und Bleicitrat kann die Probe dann mittels Transmissionselektronenmikroskop analysiert werden.